#!/bin/bash
set -x

for res in 3 5 7 9 11 13 15 21 23 25 27 29 31 33;
do

cpptraj<<EOF
noexitonerror
readdata base$res.dat name base$res
##########################################################################
# The distance between the C1′ atoms of the purine and pyrimidine pair is restricted to ≤9.5 Å
##########################################################################
datafilter base$res:4 min 7 max 9.8 out base$res-C1_C1-filtered.dat

##########################################################################
# syn purine: The syn glycosidic torsion angle (χ angle) of the purine base is in the range 0° ≤ χ ≤ 90°.
##########################################################################
datafilter base$res:5 min 0 max 90 out base$res-chi-filtered.dat

##########################################################################
# Combine both chi and C1 filters
##########################################################################
datafilter base$res:5 min 0 max 90 base$res:4 min 7 max 9.8 out base$res-C1+chi-filtered.dat

run

EOF


done