#!/bin/tcsh

perl -p -i -e "s/A5 /RA5/g" init.pdb
perl -p -i -e "s/A3 /RA3/g" init.pdb
perl -p -i -e "s/C5 /RC5/g" init.pdb
perl -p -i -e "s/C3 /RC3/g" init.pdb
perl -p -i -e "s/G5 /RG5/g" init.pdb
perl -p -i -e "s/G3 /RG3/g" init.pdb
perl -p -i -e "s/U5 /RU5/g" init.pdb
perl -p -i -e "s/U3 /RU3/g" init.pdb



